在癌症治疗的旅程中，早期检测一直是一个挑战。近年来，由于其非侵入性和高灵敏度，液体活检技术引起了广泛关注。然而，现有的检测技术往往依赖于深度靶向测序，这使得整合多种数据类型变得困难，从而影响了灵敏度和特异性。
为了解决这一技术缺陷，牛津大学的一个研究团队开发了一种基于整个基因组TET辅助吡啶硼酸测序（TAPS）的新颖多模态循环肿瘤DNA（ctDNA）检测方法。该方法的一大亮点在于能够同时分析基因组和甲基化数据，癌症诊断的灵敏度达到了94.9%，特异性为88.8%。这项突破性的技术为早期癌症筛查和患者分层提供了新的可能性。
这项研究名为“多模态游离DNA全基因组TAPS具有高灵敏度并揭示特定癌症信号”，于2025年1月8日发表在《自然通讯》杂志上。研究背景表明，尽管早期癌症检测对于改善患者预后至关重要，但当前的筛查方法仅覆盖不到30%的癌症类型，并且许多筛查方法需要侵入性操作，接受率较低。虽然多癌种早期检测技术可以实现非侵入性测试，但在无症状人群中常常有较高的假阳性率，限制了其应用。
牛津团队的TAPS技术通过一种非破坏性方法，在低ctDNA浓度下保持高灵敏度。研究人员通过对61名癌症患者和30名非癌症对照样本进行深度测序验证了该方法的准确性。
该团队还开发了一种多模态数据分析流程，将拷贝数变异、体细胞突变和甲基化信号整合起来，以增强ctDNA检测的灵敏度。结果显示，在临床样本中这种方法实现了85.2%的检测灵敏度，远超单一数据模态的结果。
尽管这种方法在早期癌症检测和术后监测方面具有显著优势，但在实际应用中仍面临一些挑战，如高测序成本和资源有限的临床环境。未来的研究可以进一步优化测序技术，使其适用于更多类型的癌症。
总结：本文介绍了牛津大学研究团队开发的一种新型多模态循环肿瘤DNA（ctDNA）检测方法——基于整个基因组TET辅助吡啶硼酸测序（TAPS）。该方法能够同时分析基因组和甲基化数据，并在临床样本中实现了较高的灵敏度和特异性。虽然这项技术在早期癌症筛查方面具有显著优势，但仍需克服实际应用中的挑战。
